生物信息之心态分析

每一个分析之旅,尽管分析千差外别,而那份感觉或者心情却有几份的相像,轻轻的,却能感觉到。人类基因组测序已经十多年了,而近几年随着测序技术的发展,测序的成本呈指数下降,而测序产生的数据量呈指数上升,数据分析的需求开始激增,这就是我们所处的这个行业这个时代。

常常看到关于2000年那轮互联网泡沫的描述,经历了一场泡沫,互联网还成就了许多著名的公司,真真切切的融入与影响着我们的生活。而生物领域,同样,我们更为真切的感觉到了分子生物学泡沫对我们一代或者几代人的影响,想当年分子生物学、生物工程专业是多么的热门,大学了纷纷增设相关专业或者现有的专业改名与之挂靠,而以至于现在生物学方面的硕士博士的泛滥,同样相对的待遇也是同样的低。“二十一世纪是生物学的时代”,多么响亮的口号,而目前就公司于行业产值,还丝毫没有看到这方面的影子。

基因、分子克隆,转基因,生物工程到如今基因组、蛋白质组、转录组等各种组学、以及二代测序、个性化医疗,更多的应用还属于科研领域。科研、课题、博导、文章、圈子以及种种的外围切割,就是那一滩水。对于病毒、癌症、生物发酵、育种等等,关于生命本身的认识,并没有因为数据的增加,而有什么本质的改变。而数据仅仅只是给了我们对于生命的另外一个层面的描述,就如同对于绿叶、红花、肌肉的描述一样。数据堆砌着,文章累计着,有人从时间推测着,百年了,该有所质的突破了。。。

铛铛…..,又有新数据了,从测序公司拿到或者网上下载到,期盼已久的数据,怀着无比的希望打开,开始迫不及待的进入分析之旅。使用各种工具,加载各种算法,机器轰鸣着,一番运行,似乎经过运算,我们就能读懂数据中的一切,而几天下来,给我们的确实相反的沮丧,心里或许开始抱怨糟糕的设计、糟糕的数据质量、糟糕的算法。。。和想想中的差之千里。而生活还得继续,带着沮丧之情,肩负着艰巨的使命,继续挖掘。

而几轮的沮丧之后,开始渐渐明白

一个混沌进入另一个混沌,而或许正因为太广,太容易目空一切

测序的物种多了,测序的数量多了,我们却没有看到突飞猛进,反而平添了几分忧愁。

信息本身的复杂性,看看研究最多的人类基因组,看看身披无数文章的模式生物

观察数据,也就是测序样本、测序数据本身的有限性

我们需要在两者中间取得一个平衡,得到一个可信的结论。

即便是突破也是层级式的,一层层,或许看到的还是那份混沌,最少你应该明白,那就是你所期望的。

告别沮丧,怀着敬畏,尝试着,不断寻找与尝试着挖掘

如果,测序如水,不在制约,有人说,分析将成为制约,制约则意味着价值,不知道价值变成现金的日子,还会不会太远。

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