数据库信息系统中文献整合的价值

下一步有时间,决定将文献模块做为插件形式整合到主题数据库系统中,文献的价值可能一直被低估了。

文献整合的价值

对于科学研究,一直以来其研究成果都是以文章的形式发布的。比如对于基因的研究,现代信息系统的飞速发展,将文章的成果要最后变成对于基因组进行注释的数据,保存到数据库中,给研究结果的查询、比较提供了极大的便利。但是可以想象得到,不是所有的文章都将结果提交的NCBI了,特别是有些结果可能不能直接的提交。如何以及用怎样一种形式来进行这些文章的整合,对于物种基因组为主题的数据库系统来说,估计也是其否能被领域认可的一个重要因素。充分研究文章结果的各种存在形式,以及一个非常方便的,一个团体参与共同进行注释的系统,也许也是一个关键所在。

文献模块的初步设计

主要功能:

  • 手动添加文献
  •  通过pubmed id增加文献摘要
  • 文献全文上传
  • 文献翻译
  • 文献与基因、序列,物种的关联
  • 文献的收藏,我的文献

文献模块以插件的形式开发,要考虑好文献与不同模块的关联,比如与基因、蛋白质核酸序列等数据的关联,与用户的关联,与项目的关联,如何在不改动原来模块的情况下,将文献模块融合的各个模块中。

以前也做过文献模块,要从中吸取经验,增加系统的可用性。同时要注意边界,不要扩的太散,最后变成什么都不是。

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